Magyarországon természetvédelmi szempontból a Rákosi vipera a legkiemeltebb védelmi kategóriába tartozik. A vadon élő egyedek száma annyira kevés, hogy minden ismert előfordulási helyén a területkezelés alá van rendelve a Rákosi vipera élőhelyi igényeinek. Védelmének érdekében alakult meg hazánkban a Rákosi vipera Védelmi Központ [www.rakosivipera.hu], amely egyedülállóan biztosítja a faj fennmaradását.